Nace de la unión de Senasica con la Sagarpa con el propósito de tener un programa para controlar, prevenir y notificar un estatus fitosanitario de las Zonas productoras del país basado bajo 4 criterios:
Los Objetivos del Programa de Vigilancia Epidemiológica Fitosanitaria son: Detectar de manera oportuna, así como identificar y verificar la incidencia, dispersión y comportamiento de plagas de alto potencial de ingreso al país. Conocer el panorama Fitosanitario de manera oportuna a través de mapas de disposición de plagas y de riesgo Fitosanitario. Proporcionar el sustento técnico-científico a la planeación, programación y evaluación de acciones en materia de Sanidad Vegetal para quienes formulen y toman políticas de alto impacto Fitosanitario.